Он вел дело об убийстве журналиста «Новой газеты» Игоря Домникова, с 2003 года все дела, которые возбуждались по материалам Анны Политковской, дело сотрудника ОМОНа Лапина С.В. (кличка «кадет»), совершившего зверства в отношении мирных граждан Чечни. Представлял интересы потерпевших в уголовном деле «Норд-Оста», в массовом милицейском беспределе в Благовещенске. Станислав Маркелов был первым и единственным из неместных адвокатов длительно работающих непосредственно на территории Чеченской республики.
Кроме того, Маркелов в разное время представлял интересы участников антифашистского движения, и принимал активное участие в зоозащитной деятельности. Станислав исповедовал принципы вегетарианства, и участвовал в кампаниях "Виты": - в защиту животных и ветврачей от репрессий Наркоконтроля (ФСКН), лишивших животных России наркоза; - в защиту студентов, отказавшихся от опытов на животных; - за принятие Федерального Закона "О защите животных от жестокого обращения" - в защиту бельков и др.
"К сожалению, сегодня в России нередко интересы бизнеса преобладают над этикой. Животные воспринимаются как сырьё, - говорит адвокат Станислав Маркелов. - Я беседовал с главой сети меховых салонов, который мне заявил: "Если это будет покупаться - мы и из "Красной книги" шубу сделаем!" Выражаем глубокое соболезнование родным и друзьям Станислава Юрьевича. Скорбим и помним...
